第二期北西太平洋鯨類捕獲調査（JARPNII）は、国際捕鯨取締条約第8条（別記参照）に基づいて当研究所が政府の許可を受けて実施しており、2000年より2年間の予備調査を実施した後、2002年より本格調査を実施しています。
調査目的：
①鯨類の摂餌生態、生態系における役割に関するデータの収集、
②鯨類及び海洋生態系における海洋汚染の影響調査、
③鯨類の系群構造の解明
調査海域：
北緯35度以北、日本沿岸から東経170度にかけた北西太平洋(7、8及び9海区)。
但し、オホーツク海並びに外国の200海里水域を除く。
目標標本数：
ミンククジラ １００頭＊
イワシクジラ １００頭
ニタリクジラ ５０頭
マッコウクジラ １０頭
＊：この他、本年は4月から5月に三陸沿岸で、また9月から10月にかけて道東沿岸でミンククジラを対象とした沿岸域調査が実施されることになっており、三陸沿岸については、既に終了しています（これらの標本数は各60頭）。
本年調査は、梅雨前線の停滞による荒天・雨天などの影響も受け、ガスのために視界が悪い日が多いなど天候には恵まれませんでしたが、多くの鯨類を発見して順調に調査を進め、予定された調査期間内にほぼ計画通りの標本数を得て終了することが出来ました。
今年の調査では、7、8海区及び9海区の全海域において調査を実施しました。
その結果、以下のような鯨類の摂餌生態に関する重要な情報を得ることが出来ました。
① ミンククジラは、海域や時期によって餌種を変え、沖合域では初夏（5～6月）にカタクチイワシを、盛夏（7～9月）にサンマを捕食し、沿岸ではオキアミやイカナゴ、カタクチイワシ、サンマ、スケトウダラと幅広い餌種を利用していることをこれまで明らかにしてきましたが、今年は、餌生物として重要な位置を占めていたカタクチイワシが、初夏の沖合域のミンククジラの胃からはほとんど認められず（主にオキアミを捕食）、盛夏になって同種の胃から、カタクチイワシがサンマとともに認められ、ミンククジラの餌生物としてのカタクチイワシの重要性が例年に比べて小さい傾向を示しました（沿岸域のミンククジラは主にスケトウダラを利用しており、これまでの調査結果と同様でした）。
JARPNII調査では俊鷹丸によって鯨類の餌生物の分布量調査も同時期（8月）に実施しており、今回観察されたミンククジラの食性変化については、餌生物の分布とその量とも併せて、今後検討していく予定にしています。
② イワシクジラは、調査海域の東側境界線である東経170度付近まで広く分布することが、今年の調査からも確認されました。
これらのイワシクジラは、6月～7月に調査した9海区の南側海域（北緯40度以南）では、主にカイアシ類やオキアミ類などの動物プランクトンを捕食しており、一方、8月の9海区の北側（北緯40度以北）では、カイアシ類やオキアミ類などの動物プランクトンに加えて、サンマなどの魚類を捕食しており、イワシクジラも時期や海域によって異なる餌生物を利用していることが示されました。
③ ニタリクジラは、5月～6月の沖合域（8から9海区）では、南側海域（北緯38度以南）で発見されたものの、その発見数は少なく、胃からはこれまでと同様にオキアミを主に捕食していたものの、胃の充満度は例年に比べて低い傾向を示しました。
一方、7月の7海区の南側（北緯38度以南）では、比較的多数のニタリクジラが発見され、その胃からはオキアミとカタクチイワシが認められました。今年のニタリクジラの分布は西側に偏っている傾向を示しました。
④ マッコウクジラは、これまでの調査で情報の少なかった沖合域（8、9海区）で主に採集を実施し、5頭を調査しました。
その結果、ヒロビレイカやクラゲイカなどの中深層性イカ類を主に捕食しており、また沖合でも中深層性魚類を利用するなど、マッコウクジラの食性に関する情報が蓄積されています。
（参考）国際捕鯨取締条約第8条抜粋
１．この条約の規定にかかわらず、締約政府は、同政府が適当と認める数の制限及び他の条件に従って自国民のいずれかが科学的研究のために鯨を捕獲し、殺し、及び処理することを認可する特別許可書をこれに与えることができる。
２．前記の特別許可書に基づいて捕獲した鯨は、実行可能な限り加工し、また、取得金は、許可を与えた政府の発給した指令書に従って処分しなければならない。
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