目視採集船の数は計画された標本数と調査の内容に関係する。予備調査では2隻を用いたが、その調査結果を検討して、本格調査からは3隻の目視採集船を投入している。また、当然のことながら、捕鯨船をこの目視採集船として用いている。

調査船団は、調査員、船員、事業員、監督官で構成され、調査員は、必ずそれぞれの目視採集船、目視専門船と調査母船に乗船している。また、時には報道関係者が便乗する場合がある。