市場調査
ノルウェーやアイスランドの場合と同様、日本は小売市場で販売される大型クジラ製品の由来を追跡・モニターするためにDN情報に基づくシステムを採用しています（図1）。このような任務は、日本政府（水産庁）により、毎年外部委託事業として日本鯨類研究所に委ねられています。
図1．日本国内の小売市場で販売される大型鯨製品のDNAモニターシステムのフローチャート。
このシステムは以下の二つの主な構成要素から成っています。i) 日本で合法的に捕獲（混獲を含む）された大型鯨類および日本に輸入された大型鯨類の遺伝子プロファイルを含むDNA登録簿、およびii) 小売市場で販売されている大型クジラ製品の体系的な調査です。このプログラムの目的は、市場で入手された大型クジラ製品のDNAプロファイルと登録簿のDNAプロファイルを照合することで、大型鯨類の違法捕獲や違法輸入を防止することです。
日本のDNA登録簿には、以下の異なる出所から採取された大型鯨類のDNAプロファイルが含まれています。
ⅰ)南極海における過去の特別許可に基づく鯨類捕獲調査プログラム（JARPA/JARPAIIおよびNEWREP-A）。このカテゴリーには、1987/88年から2018/19年までに捕獲されたクロミンククジラ、および2005/06年から2011/12年までに捕獲されたナガスクジラが含まれます。
ⅱ)西北太平洋における過去の特別許可による鯨類捕獲調査プログラム（JARPN/JARPNIIおよびNEWREP-NP）。このカテゴリーには、1994年から2019年までに捕獲されたミンククジラ、2000年から2019年までのニタリクジラ、2002年から2019年までのイワシクジラ、および2000年から2013年までのマッコウクジラが含まれます。
ⅲ)日本の排他的経済水域（EEZ）内での商業捕鯨。2019年以降に捕獲されたミンククジラ、ニタリクジラ、イワシクジラ、ナガスクジラが含まれます。
ⅳ)定置網で混獲された鯨類（主にミンククジラ、2001年7月1日から登録システムを開始）。
ⅴ)輸入品。2008年以降のノルウェーからの北大西洋ミンククジラおよびアイスランドからの北大西洋ナガスクジラが含まれます。
特別許可による鯨類捕獲調査プログラムおよび現在の商業捕鯨において、すべての捕獲されたクジラから遺伝子解析用のサンプルが研究者によって採取されています。さらに、種別、捕獲日時・場所（経度・緯度）、体長、性別、成熟状態などの多くの情報が確立されたプロトコルに基づき収集されています。
混獲されたクジラの場合は、漁師から送られた冷凍皮膚または筋肉サンプルが使用されます。
DNA登録簿では、以下の遺伝子マーカーが使用されています。
ⅰ)ミトコンドリアDNA（mtDNA）の制御領域の5’末端部分から抽出された約500塩基対（bp）の破片。これは、クジラ製品の由来（種の識別）を判定するために、登録簿のDNA配列（タイプ）と小売市場で収集された未知ンプル（テスト）と系統解析で比較します。
ⅱ)マイクロサテライトDNA（各種において13～17の遺伝子座を用いた遺伝子型解析）は、個体識別を目的として使用されます。および、
ⅲ)Y染色体DNA。性別の判定を目的として使用されます。
日本国内の市場におけるサンプリングについては、クジラ製品および市場運営に熟知した技術者1～2名が、毎年小売店においてクジラ製品のサンプリングを実施しています。毎年、9月から12月にかけて日本全国で約18都市や町を含む地域で約350サンプルが採取されます。サンプリングは日本列島全体をカバーするように努力されていますが、サンプリング方法は無作為抽出ではありません。各クジラ製品サンプルについて、製品の種類、入手場所、日時、重量、価格といった情報も収集され、サンプリングされた後は日本鯨類研究所に送られ遺伝的分析が行われます。
「テスト」と「タイプ」のミトコンドリアDNA（mtDNA）配列に対する標準的な系統解析が実施され、サンプリングされたクジラ製品の種を同定し、個体識別の照合を行います。「テスト」と「タイプ」の比較結果は、水産庁への年次報告書にまとめられています。
これまでの調査結果から、DNA登録データベースのシステムは日本の小売市場における大型鯨類製品の由来追跡・モニターに有効な手段であると結論付けられます。
資料
・日本の国内市場に流通する鯨製品のDNA登録による監視制度. 後藤睦夫、及川宏之著. 鯨研通信第490号. 2021/6.
・「日本国内における鯨製品の流通の実態について―捕獲統計と市場調査から－」 藤瀬良弘・後藤睦夫著. 鯨研通信415号. 2002/9.